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2021版《結(jié)直腸癌分子檢測高通量測序中國專家共識》發(fā)布,哪些硬核要知道?

近日,《臨床腫瘤學(xué)雜志》發(fā)布了2021版《結(jié)直腸癌分子檢測高通量測序中國專家共識》(以下簡稱“共識”), 該《共識》由中國抗癌協(xié)會靶向治療專業(yè)委員會發(fā)起,在臨床、病理等多個領(lǐng)域20余名專家指導(dǎo)下,以及行業(yè)內(nèi)10余家頭部診斷企業(yè)的參與支持下,結(jié)合結(jié)直腸癌實際診療需求,分別從結(jié)直腸癌NGS檢測的臨床角度和實驗室流程質(zhì)控角度出發(fā)提供指導(dǎo)意見,歷經(jīng)一年反復(fù)討論,正式發(fā)表于《臨床腫瘤學(xué)雜志》2021年3月第26卷第3期。

 
2021版《共識》的推出,基于什么背景?究竟有何重要意義,又有哪些精彩看點(diǎn)?
 
 
2021版《結(jié)直腸癌分子檢測高通量測序中國專家共識》. 臨床腫瘤學(xué)雜志. 2021;26(3):253-264
 
NGS賽道火熱,質(zhì)控流程亟需規(guī)范
 
結(jié)直腸癌在我國的發(fā)病率呈逐年上升的趨勢,世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究機(jī)構(gòu)(International Agency for Research on Cancer, IARC)數(shù)據(jù)顯示,我國2020年結(jié)直腸癌的新發(fā)病例數(shù)為56萬例,因結(jié)直腸癌死亡病例達(dá)29萬例[1]。約25%的結(jié)直腸癌患者在診斷時已出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。此外,30 %的患者在治療過程中發(fā)生轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者預(yù)后較差,5年生存率降至11.7%[2]。
 
近年來,隨著診療水平的進(jìn)步和靶向藥物、免疫治療的出現(xiàn),越來越多的結(jié)直腸癌患者跨越了五年生存期,實現(xiàn)了更長的生存獲益。在轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者中,RAS基因野生型的患者能夠通過特定的精準(zhǔn)靶向治療藥物(如抗EGFR單抗)實現(xiàn)生存獲益,預(yù)后良好。
 
分子標(biāo)志物檢測是篩選靶向治療獲益人群的前提,近年來隨著檢測技術(shù)的飛速發(fā)展,二代高通量測序(next generation sequencing, NGS)由于能夠一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,快速生成非常大的基因組學(xué)、表觀基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究數(shù)據(jù)集,無疑為精準(zhǔn)診斷提供了更大可能性。NGS檢測在通量、成本及效率等方面的綜合優(yōu)勢,在腫瘤基因突變檢測中展現(xiàn)出越來越廣闊的應(yīng)用前景。
 
隨著結(jié)直腸癌精準(zhǔn)診療的發(fā)展,院內(nèi)NGS平臺明顯增長,能做NGS檢測的第三方實驗室數(shù)量繁多,NGS儀器及試劑組合多樣化,各平臺采用不同的性能參數(shù),對檢測質(zhì)量管理要求帶來諸多挑戰(zhàn)。NGS檢測技術(shù)流程復(fù)雜,對實驗室環(huán)境條件、人員能力及質(zhì)量管理要求高,任何一個環(huán)節(jié)出現(xiàn)問題,均會影響檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性,進(jìn)而影響臨床決策[3]。
 
為保證臨床診療工作的準(zhǔn)確性和規(guī)范性,由臨床醫(yī)師結(jié)合結(jié)直腸癌實際診療需求發(fā)起,病理及檢驗專家指導(dǎo),業(yè)內(nèi)頭部診斷企業(yè)參與,分別從結(jié)直腸癌NGS檢測的臨床角度及實驗室流程質(zhì)控角度共同起草了中國專家共識,用以指導(dǎo)NGS檢測技術(shù)在結(jié)直腸癌診療中的規(guī)范應(yīng)用。
 
從臨床和實驗室,立足于建立行業(yè)規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn),《共識》六大精彩亮點(diǎn)搶先看
 
為了解決目前臨床應(yīng)用中存在的問題,提高相關(guān)行業(yè)從業(yè)者對結(jié)直腸癌分子檢測NGS的了解及應(yīng)用,2021版《共識》的發(fā)布,首次提出臨床規(guī)范和實驗室規(guī)范,從結(jié)直腸癌生物標(biāo)志物檢測的臨床意義,到樣本處理及轉(zhuǎn)運(yùn)、報告解讀及標(biāo)準(zhǔn)模板、NGS實驗室建設(shè)的要求等方面,以期指導(dǎo) NGS檢測技術(shù)在結(jié)直腸癌診療中的規(guī)范應(yīng)用,體現(xiàn)在:
 
1)臨床醫(yī)生規(guī)范取樣和更精準(zhǔn)的報告解讀;
2)NGS行業(yè)更好地規(guī)范,保證檢測流程及報告的準(zhǔn)確性,為結(jié)直腸癌靶向治療和免疫治療提供更加標(biāo)準(zhǔn)的參考依據(jù)。
 
問《共識》哪些亮點(diǎn)值得關(guān)注?
 
亮點(diǎn)1:從結(jié)直腸癌NGS檢測的臨床應(yīng)用及實驗室流程質(zhì)控出發(fā),由整個行業(yè)產(chǎn)業(yè)鏈的專家共同起草規(guī)范及標(biāo)準(zhǔn);
亮點(diǎn)2:明確了“必要的”和“可選開展的”結(jié)直腸癌診療相關(guān)生物標(biāo)志物;
亮點(diǎn)3:收集了目前市場上部分NGS公司提供的TMB試劑盒信息;
亮點(diǎn)4:對不同疾病階段的分子檢測內(nèi)容作了明確推薦;
亮點(diǎn)5:提供了NGS檢測報告模板;
亮點(diǎn)6:明確了NGS實驗室建設(shè)的參考文件。
 
NGS快速發(fā)展,加強(qiáng)行業(yè)監(jiān)管成國際共識
 
 
 
 
隨著NGS技術(shù)快速發(fā)展,行業(yè)規(guī)范不斷變化也給實踐應(yīng)用帶來各種挑戰(zhàn),全球各國監(jiān)管機(jī)構(gòu)都在積極制定規(guī)范,推進(jìn)基因檢測行業(yè)的健康發(fā)展。
 
在美國,臨床實驗室受到若干理事機(jī)構(gòu)的監(jiān)督。如美國病理學(xué)家學(xué)院(CAP),為臨床實驗室制定最佳實踐指南。隨著分子技術(shù)的發(fā)展,美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)(ACMG)和分子病理學(xué)協(xié)會(AMP)等組織也進(jìn)入該領(lǐng)域。2015年,ACMG和AMP發(fā)布了關(guān)于臨床診斷基因檢測解釋的聯(lián)合指南。這些指南強(qiáng)烈建議臨床分子遺傳學(xué)檢測在認(rèn)證實驗室進(jìn)行,并具體到包括誰可以解釋結(jié)果的具體內(nèi)容。
 
在我國,基因檢測已經(jīng)成為腫瘤臨床精準(zhǔn)診治的前提,但關(guān)于NGS應(yīng)用形成的共識有限。2017年,我國正式出版了《ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南》中文版,并已獲得ACMG的官方授權(quán)。此后,NGS技術(shù)在結(jié)直腸癌、血液腫瘤、肺癌等疾病中的應(yīng)用共識陸續(xù)出臺。如今,2021版《結(jié)直腸癌分子檢測高通量測序中國專家共識》的發(fā)布,可以預(yù)見的是,未來隨著基因檢測行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范日趨完善,將會進(jìn)一步推動結(jié)直腸癌的精準(zhǔn)診療和NGS技術(shù)的規(guī)范應(yīng)用。
 
最后
 
NGS有明顯的通量優(yōu)勢及發(fā)現(xiàn)未知基因變異的優(yōu)勢,但是在使用中也存在包括檢測技術(shù)、數(shù)據(jù)管理、分析與報告、解讀與臨床咨詢等方面的各種挑戰(zhàn)。2021版《共識》正式發(fā)布必將在推動NGS規(guī)范化道路上發(fā)揮重要的作用,為臨床醫(yī)生和行業(yè)檢測者提供了規(guī)范和有價值的指導(dǎo)意見,除了助力臨床醫(yī)生的精準(zhǔn)治療決策提供參考依據(jù),也為臨床實驗室的檢測與質(zhì)量控制實現(xiàn)規(guī)范化與標(biāo)準(zhǔn)化。
 
2021年4月21日,《共識》也通過中國醫(yī)學(xué)論壇報進(jìn)行線上直播發(fā)布,多位專家分別寄語:
 
中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院院長徐瑞華教授:
 
徐瑞華教授
 
結(jié)直腸癌精準(zhǔn)診療飛速發(fā)展,如今已進(jìn)入到分子病理時代,在這一趨勢下以高通量測序NGS技術(shù)為代表的精準(zhǔn)檢測逐漸從科研實驗室走向臨床應(yīng)用。對轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者進(jìn)行基因檢測所獲得的信息,對治療及預(yù)后會產(chǎn)生非常重要的影響。此次《共識》的落地,使得結(jié)直腸癌精準(zhǔn)檢測又向前邁進(jìn)了一步。希望通過各個醫(yī)院、臨床單位、以及精準(zhǔn)診斷企業(yè)的共同努力,推動基因檢測和報告的規(guī)范化,也希望通過我們的努力,未來將基因檢測早日納入醫(yī)保,減輕患者的負(fù)擔(dān)。
 
北京協(xié)和醫(yī)院病理科主任梁智勇教授:
 
梁智勇教授
 
隨著近年來中國院內(nèi)分子病理平臺數(shù)量逐年增加,PQCC推動中國分子病理質(zhì)控發(fā)展,結(jié)直腸癌分子病理檢測規(guī)范也在不斷更新。但是,國內(nèi)的基因檢測普及情況、結(jié)直腸癌生物標(biāo)志物檢測尤其是RAS基因檢測率、以及檢測流程的規(guī)范化程度,與歐美國家相比仍有差距,基層醫(yī)院的檢測能力也亟待提升,還有很多醫(yī)院的分子檢測平臺亟待完善。相信本《共識》的發(fā)布也會給廣大的臨床醫(yī)生和病理科醫(yī)生帶來指導(dǎo)性的意義,在臨床實踐中將基因檢測做得更準(zhǔn)確、更規(guī)范,惠及更多結(jié)直腸癌患者。
 
特別鳴謝
 
此次《共識》的撰寫從準(zhǔn)備到發(fā)布,得到20多位臨床、病理及檢驗專家的指導(dǎo)以及十余家精準(zhǔn)診斷頭部企業(yè)的支持,包括:
 
專家組成員(按姓氏拼音排名):白威(山西省腫瘤醫(yī)院),郭增清(福建省腫瘤醫(yī)院),胡曉樺(廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院),李宇紅(中山大學(xué)腫瘤醫(yī)院),劉靜(上海瑞金醫(yī)院),邱萌(四川大學(xué)華西醫(yī)院),王峰(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),徐瑞華(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),應(yīng)杰兒(中國科學(xué)院大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),張艷橋(哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),曾珊(中南大學(xué)湘雅醫(yī)院)
 
撰寫組成員(按姓氏拼音排名):陳功(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),梁智勇(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院),梁莉(南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院),邵建永(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),蘇丹(中國科學(xué)院大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),唐源(四川大學(xué)華西醫(yī)院),王峰(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),萬德森(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),吳煥文(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院),薛衛(wèi)成(北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院),徐瑞華(中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院),應(yīng)建明(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院),張波(北京大學(xué)第三醫(yī)院),周煒洵(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院),周曉燕(復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院)
 
診斷企業(yè)(按公司名首字母排序):廣州金域醫(yī)學(xué)檢驗集團(tuán)股份有限公司、廣州燃石醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司、江蘇先聲醫(yī)學(xué)診斷有限公司、南京世和基因股份有限公司、求臻醫(yī)學(xué)科技(北京)有限公司、上海鹍遠(yuǎn)生物技術(shù)有限公司、上海睿昂基因科技股份有限公司、上海思路迪生物技術(shù)有限公司、無錫臻和生物科技股份有限公司、廈門艾德生物醫(yī)藥科技股份有限公司、因美納(中國)科學(xué)器材有限公司、至本醫(yī)療科技(上海)有限公司。
 
 
【參考文獻(xiàn)】
1、International Agency for Research on Cancer. Latest global cancer data: Cancer burden rises to 19.3 million new cases and 10.0 million cancer deaths in 2020[EB/OL].[2021-01-10].https://www.iarc.fr/faq/latest-global-cancer-data-2020-qa/.
2、Siegel R, DeSantis C, Virgo K, et al. Cancer treatment and survivorship statistics, 2012. CA Cancer J Clin 2012;62:220-41.
3、北京市臨床檢驗中心,北京醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會,首都醫(yī)科大學(xué)檢驗診斷學(xué)系,等.高通量測序技術(shù)臨床檢測規(guī)范化北京專家共識(第一版通用部分)[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2019,99(43): 3393-3397.
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