作者:袁玉華 單位:天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院空港醫(yī)院檢驗(yàn)科
新型冠狀病毒(COVID-19)核酸檢測(cè)作為新冠病毒感染實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn),實(shí)驗(yàn)過(guò)程的質(zhì)量控制尤為重要,新冠病毒核酸檢測(cè)必須使用質(zhì)控品和標(biāo)準(zhǔn)品,才能保證結(jié)果的可靠。
2020年11月5日國(guó)務(wù)院應(yīng)對(duì)新冠肺炎疫情聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制醫(yī)療救治組《關(guān)于加強(qiáng)外送樣本新冠病毒核酸檢測(cè)質(zhì)量管理工作的通知》中進(jìn)一步明確:“每批次檢測(cè)時(shí),應(yīng)當(dāng)隨機(jī)放入至少1份弱陽(yáng)性(1.5-3倍檢測(cè)限)和3份陰性室內(nèi)質(zhì)控樣本,進(jìn)行質(zhì)量控制,以及時(shí)發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,避免假陰性和假陽(yáng)性”,進(jìn)一步強(qiáng)化了新冠核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制的要求。
新冠病毒的高致病性及不穩(wěn)定性,限制了患者陽(yáng)性樣本作為天然質(zhì)控品及標(biāo)準(zhǔn)品的應(yīng)用,因此,一個(gè)穩(wěn)定可靠、且無(wú)生物傳染性的 RNA 質(zhì)控品和標(biāo)準(zhǔn)品,對(duì)于保證新冠病毒的 RT-PCR檢測(cè)質(zhì)量具有重要意義。
在核酸檢測(cè)過(guò)程中,為保持與實(shí)際檢測(cè)樣品間擴(kuò)增效率的一致性,作為標(biāo)準(zhǔn)品應(yīng)盡量選擇與實(shí)際檢測(cè)樣品結(jié)構(gòu)近似的樣品。
鑒于目前COVID-19核酸檢測(cè)的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)或參考物質(zhì)尚未建立,WHO頒布的“Emergency Use listing(EUL): Instructions for Submission Requirements: In vitro diagnostics (IVDs) Detecting SARS-CoV-2 Nucleic Acid”推薦可以使用體外轉(zhuǎn)錄RNA 或假病毒作為新冠病毒核酸檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品及質(zhì)控品。
假病毒是一類(lèi)嵌合型病毒顆粒,通過(guò)基因工程手段構(gòu)建出含有目的核酸片段及包裝蛋白形成的復(fù)合體。1998年P(guān)asloske[1,2]等開(kāi)始提出了裝甲R(shí)NA(armored RNA)技術(shù),即由MS2噬菌體外殼蛋白包裹重組RNA的技術(shù),這種假病毒無(wú)感染性,無(wú)自主復(fù)制能力,生物安全性高,核酸穩(wěn)定,不易降解。另外一種是慢病毒載體系統(tǒng)構(gòu)建假病毒,將目標(biāo)基因克隆入慢病毒載體,與包裝質(zhì)粒一起轉(zhuǎn)染 HEK293T細(xì)胞,包裝出假病毒,該技術(shù)制備的假病毒具有假病顆粒穩(wěn)定、安全,且可有效監(jiān)控RNA樣品核酸制備及RT‐PCR反應(yīng)中逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程[3,4]。
由于新冠病毒是RNA包膜病毒,慢病毒載體包裝病毒無(wú)論在病毒直徑和病毒包膜的結(jié)構(gòu)上,都相對(duì)噬菌體更接近冠狀病毒的結(jié)構(gòu),可以更真實(shí)地模擬臨床樣本,為多數(shù)質(zhì)控品生產(chǎn)廠商采用的新冠假病毒制備方法。
人工合成的假病毒耐核酸酶作用,穩(wěn)定性好,易保存和運(yùn)輸,能夠參與從樣品處理到擴(kuò)增的全程質(zhì)量監(jiān)測(cè),即可作為室內(nèi)質(zhì)控品監(jiān)測(cè)實(shí)驗(yàn)精密度,也可定值后作為室間質(zhì)控品[5]。體外人工合成的新冠病毒基因組RNA(裸RNA)可作為新冠病毒標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)相應(yīng)擴(kuò)增試劑進(jìn)行性能驗(yàn)證。
目前,假病毒質(zhì)控品已大規(guī)模應(yīng)用于新冠病毒核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,但在選擇假病毒質(zhì)控品的時(shí)候仍需注意幾個(gè)問(wèn)題:
1、實(shí)驗(yàn)室需明確所使用的假病毒質(zhì)控品包含RT-PCR擴(kuò)增試劑檢測(cè)的靶基因,因不同檢測(cè)方法學(xué)及試劑盒針對(duì)的基因及靶序列各異,推薦使用包含新冠病毒全基因組的質(zhì)控品,確保所使用的質(zhì)控品適用實(shí)驗(yàn)室所采納的檢測(cè)技術(shù)及試劑盒(截至6月12日,國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局已批準(zhǔn)42個(gè)新型冠狀病毒檢測(cè)試劑盒上市)。
2、關(guān)注假病毒質(zhì)控品的穩(wěn)定性,在試劑盒說(shuō)明書(shū)建議的穩(wěn)定期內(nèi)使用,導(dǎo)至假病毒質(zhì)控品不穩(wěn)定的原因比較多,可能是假病毒包裹工藝不完善,也可能是生產(chǎn)質(zhì)控品流程的其他環(huán)節(jié),建議在質(zhì)控品使用前做穩(wěn)定性驗(yàn)證。
3、假病毒質(zhì)控品DNA殘留問(wèn)題,是假病毒生產(chǎn)過(guò)程中作為RNA轉(zhuǎn)錄的質(zhì)粒模板產(chǎn)生,制造商須優(yōu)化工藝,將質(zhì)粒DNA殘留減少至不影響RNA的檢測(cè),因病毒RNA的檢測(cè)需經(jīng)過(guò)RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA后再進(jìn)行PCR擴(kuò)增,如果樣本中有質(zhì)粒DNA殘留,也能直接通過(guò)PCR擴(kuò)增出來(lái),另外DNA的穩(wěn)定性遠(yuǎn)高于RNA,因此不能反映實(shí)驗(yàn)室質(zhì)控過(guò)程的真實(shí)情況,建議在質(zhì)控品使用前做質(zhì)粒DNA殘留驗(yàn)證。
4、目前市場(chǎng)上的假病毒類(lèi)質(zhì)控品多為非定值質(zhì)控品,如果用于對(duì)核酸提取效率進(jìn)行驗(yàn)證,需使用定值質(zhì)控品(可用數(shù)字PCR方法定值)[6],擴(kuò)增試劑的驗(yàn)證必須使用RNA標(biāo)準(zhǔn)品。
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